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La bibliothèque des étudiants en santé

Fiches originales, livres libres et ressources de référence, triés par matière et résumés en français.

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9415 ressources

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    Hypothyroïdie et myasthénie: à propos d’un cas

    Houda Salhi, Farida Ajdi

    Plusieurs désordres d’origine immunologique spécifiquement thyroïdiens ont été reportés chez les patients myasthéniques. Cette relation reste peu élucidée mais une réaction immunologique croisée entre la jonction neuromusculaire et les composants de la thyroïde a été retrouvé dans la myasthénie et la maladie de Basedow. Il est généralement admis que l’association hyperthyroidie et myasthénie est beaucoup plus fréquente que celle entre myasthénie et hypothyroïdie. Toutefois, aucune explication claire n'a été proposée pour expliquer de cette différence. Nous rapportons le cas d’une patiente âgée de 53 ans qui était suivie au début pour une hypothyroïdie sur probable thyroidite de Hashimoto bien équilibrée sous traitement substitutif et dont l’évolution a été marquée par la découverte d’une myasthénie au cours du suivie. Cette dernière a bien répondu au traitement par néostigmine avec une bonne évolution.

    ImmunologieLicence : The Pan African Medical Journal - ISSN 1937-8688. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
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    Hystérocèle géante

    Ahmed Ibrahimi, Idriss Ziani

    The genitourinary prolapse is a common disorder in women. It may affects three pelvic organs. The hysterocele or hysteroptosis is defined as the descent of the uterus into vagina and, in severe cases, it protrudes out of the vulva. It is more often secondary to a lack of support and suspension of the pelvic organs. We report the case of a 58-year-old woman, with no particular past medical history, who reached menopause six years before and had had two vaginal deliveries. She presented with dysuria, pollakiuria, recurrent urinary tract infections and recurrent episodes of acute retention of urine, with a sensation of pelvic heaviness and vaginal ball externalizing due to effort and at the end of the day. The clinical examination highlighted a huge stage IV hysterocele according to Baden Walker classification, with complete cervix externalization, without urinary incontinence, cystocele or associated rectocele. The patient underwent vaginal hysterectomy with good functional outcome, and disappearance of associated urinary disorders.

    Licence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ The Pan African Medical Journal (ISSN: 1937-8688). This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution International 4.0 License (), which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, p
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    Iatrogénie médicamenteuse chez la personne âgée: à propos de deux cas d’insuffisance rénale favorisée par les tricycliques

    Sodjehoun Apeti, Mawufemo Yawovi Tsevi, Matchonna Kpatcha, Eyram Yoan Amekoudi, Akomola Kossi Sabi

    L'hyperplasie prostatique est une affection courante chez l'homme à partir de la cinquantaine dont l'incidence augmente avec l'âge. Elle est préoccupante lorsqu'elle est symptomatique. Les médicaments ayant des effets néfastes sur le fonctionnement du bas appareil urinaire, peuvent favoriser l'apparition des symptômes. Parmi ceux-ci, les médicaments à effets primaires ou secondaires anticholinergiques dont les tricycliques sont souvent en cause. Ils sont contre-indiqués en cas de pathologie obstructive sous vésicale parce que pouvant être responsable de l'apparition ou l'aggravation des symptômes urinaires et des complications qui en découlent. La plus grave est l'insuffisance rénale avec ses conséquences sanitaires et économiques chez les sujets âgés souvent polypathologiques. Nous rapportons deux cas de iatrogénie des tricycliques sur l'appareil urinaire chez des patients âgés de 80 et 92ans porteurs d'hyperplasie prostatique. L'imagerie et le Bladder scan ont permis de poser le diagnostic étiologique du fait de la pauvreté sémiologique permettant une prise en charge adéquate. Ces observations justifient la réalisation systématique du toucher rectal, du Bladder scan voire d'une échographie chez tout sujet âgé présentant une insuffisance rénale aiguë ou une aggravation d'une insuffisance chronique du fait de la fréquence des pathologies prostatiques et de la polymédication à cet âge.

    PharmacologieLicence : The Pan African Medical Journal - ISSN 1937-8688. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
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    IATROPREV : création d'un parcours de soins dédié à l'optimisation médicamenteuse des personnes âgées

    Marine Verchin

    Afin de sécuriser les prises en charge et de prévenir la iatrogénie médicamenteuse chez les personnes âgées fragiles polymédiquées et polypathologiques, les centres hospitaliers universitaires de Lille et Amiens ont créé un parcours de soins dédié à l’optimisation médicamenteuse. Ce projet d’expérimentation innovant dans l’organisation des soins a été financé par l’Article 51 de la loi de financement de la sécurité sociale et soutenu par de nombreux acteurs dont l’ARS et les UPRS Médecins libéraux et Pharmacie. La création des réunions de concertation pluri professionnelles dédiées à l’optimisation médicamenteuse entre médecin généraliste, pharmacien d’officine, gériatre et pharmacien clinicien permet de développer un lien ville-hôpital grâce à un temps d’échange privilégié. Ces démarches dont les activités de pharmacie clinique sont mises en valeurs à travers la création d’un forfait financier. Ces travaux réalisent le bilan des premières inclusions du centre amiénois par la porte d’entrée hospitalière. Des améliorations permettent de s’adapter aux conditions réelles et d’optimiser le processus dans le but de pérenniser le dispositif. De nouveaux critères d’inclusion et d’exclusion ont ainsi vu le jour. Concernant l’efficacité du dispositif, les premiers résultats sont encourageants avec un bon taux de suivis des recommandations et un faible nombre de ré hospitalisation ou de passages aux urgences à 90 jours. Ces résultats sont à confirmer après les 4 années d’expérimentation en prenant en compte les données des deux centres investigateurs.

    PharmacologieToxicologiePharmacie galéniqueLicence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    ICH – Lignes directrices Qualité (Q1 à Q14)

    International Council for Harmonisation

    Normes internationales de qualité pharmaceutique : stabilité (Q1), validation analytique (Q2), impuretés (Q3), développement (Q8)…

    Chimie analytique et contrôle qualitéPharmacie galéniqueLégislation, éthique et déontologieLicence : lecture-libre
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    Ictères pathologiques du nouveau-né à l'hôpital Bonzola de Mbuji-Mayi, République Démocratique du Congo

    André Kabamba Mutombo, Olivier Mukuku, Benjamin Kasongo Kabulo, Augustin Mulangu Mutombo, Alain Mutombo Ngeleka, Junior Dibwe Mutombo, Maguy Sangaji Kabuya, Celestin Mukoko Kayembe, Oscar Numbi Luboya

    L'ictère néonatal, bien qu'il soit souvent très banal, ne doit pas pour autant être négligé car il peut relever des étiologies variées et avoir des significations différentes au point de devenir pathologique. Au cours d'une étude rétro-prospective descriptive, les auteurs analysent les aspects épidemio-cliniques, thérapeutiques et évolutifs des ictères néonataux pathologiques à l'Unité des Urgences Néonatales de Bonzola à Mbuji-Mayi (RD Congo) sur une période de 5 ans. La fréquence est de 4,9% avec une incidence annuelle de 24 cas/an. La prédominance masculine est notée avec un sexe ratio de 1,1. Ces ictères sont précoces (31,1%) et tardif (17,5%). Les principales causes sont dans 81,6% des cas dominées par les infections (42,5%) et, incompatibilité fœto-maternelle (39,1%). La symptomatologie habituelle est notée: ictère franc et pâleur cutanéo-muqueuse (100%), urines jaunes foncées (62,5%), signes neurologiques (42,5%) et généraux (47,5%). Le traitement était à la fois étiologique (60%) et symptomatique ou d'appoint (40%) et a consisté dans l'association antibiotiques avec transfusion et/ou exsanguino-transfusion (24,2%), antibiothérapie seule (35,8%), inducteurs enzymatiques (35%) et photothérapie (5%). L’évolution a été bonne dans 82,3% des cas contre 9,3% des décès.

    Microbiologie (bactériologie, virologie)PharmacologiePédiatrieLicence : The Pan African Medical Journal - ISSN 1937-8688. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
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    Idéations suicidaires chez les internes de médecine générale

    Tanguy Mercier-Albanel

    Introduction : le risque suicidaire des internes de médecine français est une problématique souvent évoquée, se pose la question de l'incidence des idéations suicidaires (IS) chez les internes de médecine générale français (IMG). Matériel et méthode : étude quantitative transversale descriptive par questionnaire anonyme diffusé en ligne sur des réseaux sociaux à destination des IMG français durant les Étés 2021 et 2022. Résultats : 532 réponses ont été recueillies dont 79.1% de femmes avec un âge médian de 27 ans, 31.8% ont déjà eu des IS dont 58% les ont confiés (plus souvent chez les femmes) et 22.6% ont eu des IS durant l'année. 13.2% ont imaginé un scénario suicidaire, 3.4% disent avoir déjà fait une tentative de suicide (TS) et 0.9% une TS dans l'année, 2.1% auraient déjà été hospitalisés pour une TS. Discussion-conclusion : les IMG français semblent plus à risque d'IS que la population générale française d'IS mais proches du risque des internes de médecine ou de la population étudiante française, il semble utile de faire la promotion des numéros d’aide gratuits et anonymes et des services et professionnels de santé mentale auprès des IMG.

    SémiologieMaladies infectieuses et tropicalesMédecine interne (cardiologie, endocrinologie, néphrologie…)Licence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    Identification and Characterization of Copy Number Variations Regions in West African Taurine Cattle

    Simple SummaryNative West African (WA) taurine (Bos taurus) cattle are trypanotolerant; i.e., they have the ability to suppress the establishment of trypanosomes. Cattle trypanotolerance is a heritable trait—partially additive in nature—that can share mechanisms with tick resistance. Copy Number Variations (CNVs) are genomic alterations affecting gene structure, gene expression, and performance. However, the relationship between CNV regions and trypanotolerance and tick resistance in WA taurine cattle has not been approached thusfar. Here, we identify and characterize CNV regions in a sample of WA taurine cattle using WA zebu as an outgroup. The CNV regions identified spanned genes that are mainly involved in innate immunity. However, their relationship with genomic regions, previously reported to be associated with trypanotolerance and tick resistance, was not clear. Therefore, CNV alterations may not be the main genomic features underlying such traits.AbstractA total of 106 West African taurine cattle belonging to the Lagunaire breed of Benin (33), the N’Dama population of Burkina Faso (48), and N’Dama cattle sampled in Congo (25) were analyzed for Copy Number Variations (CNVs) using the BovineHDBeadChip of Illumina and two different CNV calling programs: PennCNV and QuantiSNP. Furthermore, 89 West African zebu samples (Bororo cattle of Mali and Zebu Peul sampled in Benin and Burkina Faso) were used as an outgroup to ensure that analyses reflect the taurine cattle genomic background. Analyses identified 307 taurine-specific CNV regions (CNVRs), covering about 56 Mb on all bovine autosomes. Gene annotation enrichment analysis identified a total of 840 candidate genes on 168 taurine-specific CNVRs. Three different statistically significant functional term annotation clusters (from ACt1 to ACt3) involved in the immune function were identified: ACt1 includes genes encoding lipocalins, proteins involved in the modulation of immune response and allergy; ACt2 includes ge

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueMicrobiologie (bactériologie, virologie)Licence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Licensee MDPI, Basel, Switzerland. This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY) license ().
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    Identification and distribution of a GABA receptor mutation conferring dieldrin resistance in the malaria vector Anopheles funestus in Africa

    Charles S. Wondji, Roch K. Dabire, Zainab Tukur, Helen Irving, Rousseau Djouaka, John C. Morgan

    Growing problems of pyrethroid resistance in Anopheles funestus have intensified efforts to identify alternative insecticides. Many agrochemicals target the GABA receptors, but cross-resistance from dieldrin resistance may preclude their introduction.Dieldrin resistance was detected in An. funestus populations from West (Burkina Faso) and central (Cameroon) Africa, but populations from East (Uganda) and Southern Africa (Mozambique and Malawi) were fully susceptible to this insecticide. Partial sequencing of the dieldrin target site, the γ-aminobutyric acid (GABA) receptor, identified two amino acid substitutions, A296S and V327I. The A296S mutation has been associated with dieldrin resistance in other species. The V327I mutations was detected in the resistant sample from Burkina Faso and Cameroon and consistently associated with the A296S substitution. The full-length of the An. funestus GABA-receptor gene, amplified by RT-PCR, generated a sequence of 1674 bp encoding 557 amino acid of the protein in An. funestus with 98% similarity to that of Anopheles gambiae. Two diagnostic assays were developed to genotype the A296S mutation (pyrosequencing and PCR-RFLP), and use of these assays revealed high frequency of the resistant allele in Burkina Faso (60%) and Cameroon (82%), moderate level in Benin (16%) while low frequency or absence of the mutation was observed respectively in Uganda (7.5%) or 0% in Malawi and Mozambique.The distribution of the RdlR mutation in An. funestus populations in Africa suggests extensive barriers to gene flow between populations from different regions. Graphical abstractHighlights► Dieldrin resistance detected in An. funestus from West and Central Africa. ► Identification of the A296S conferring dieldrin resistance after sequencing. ► V327I mutation detected in resistant samples and associated with the A296S mutation. ► Two diagnostic assays were developed to genotype the A296S mutation. ► High frequency of RdlR in West Africa but complete a

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueMicrobiologie (bactériologie, virologie)Licence : CC BY 3.0 Open Access underlicense
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    Identification de cas de borréliose à tiques par qPCR à partir de tests rapides de diagnostic du paludisme lors du Grand Magai de Touba au Sénégal

    Coumba DIOUF, Ihssane OUADDANE, Georges DIATTA, Mamadou Lamine Bara GOUMBALA, Abdourahmane SOW, Déguène FAM, Mbayang FAYE, Philippe GAUTRET, Cheikh SOKHNA

    RÉSUMÉIntroductionLes tests de diagnostic rapide (TDR) antigéniques ont été développés pour faciliter le diagnostic du paludisme dans les zones d’endémie palustre. Le matériel sanguin collecté pour ces tests peut être utilisé pour le diagnostic d’autres infections.MéthodeUne extraction d’acides nucléiques suivie d’une identification par PCR du virus de la dengue (DENV), Borrelia spp, Bartonella spp et Coxiella burnetti a été effectuée sur des TDR collectés dans différents structures sanitaires de Touba lors du Grand Magal de Touba (GMT), un rassemblement de masse connu pour ses risques infectieux.Résultats2 381 TDR ont été collectés dans huit structures sanitaires du département de Mbacké en 2022 et 2023 pendant le GMT. Treize cas (0,5%) de borréliose de type fièvre récurrente transmise par les tiques ont été identifiés par qPCR dont deux cas de co-infection paludisme-borréliose. Aucun des échantillons n’a été positif pour le virus de la DENV, Bartonella spp et C. burnetti.ConclusionNos résultats confirment que les antigènes de TDR peuvent être exploités pour le diagnostic de fièvres non palustres comme la borréliose présente chez certains participants fébriles du GMT. Les TDR du paludisme, utilisés sur le terrain, constituent une source facilement accessible d’échantillons cliniques pour étudier l’épidémiologie des causes de fièvre d’origine inconnue dans le contexte du GMT.

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueBiostatistiques et épidémiologieLicence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ Cet article en libre accès est distribué selon les termes de la licence Creative Commons CC BY 4.0 ().
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    Identification des facteurs prédictifs de la reprise d’activité professionnelle chez les patients suivis au CETD du CHU Amiens-Picardie pour un SDRC type 1

    Sofiane Zid

    Introduction : le syndrome douloureux régional complexe de type 1 est une pathologie chronique et invalidante. La physiopathologie reste mal élucidée. Ce syndrome représente un problème de santé publique avec un impact sur la reprise de l’emploi. L’objectif de notre étude est de déterminer différents facteurs impliqués dans la reprise ou la non-reprise de l'activité professionnelle chez les patients atteints de SDRC de type I et suivis au Centre d’Etude et de Traitement de la Douleur au CHU d’Amiens entre 2018 et 2021. Matériels et méthodes : cette étude est rétrospective, monocentrique et réalisée au CETD du CHU d'Amiens entre 2018 et 2021. 102 patients sont diagnostiqués SDRC de type I. Divisés en deux groupes selon la reprise ou pas de l’emploi. Les données ont été recueillies à partir des dossiers médicaux. Résultats : 52 patients ont repris une activité professionnelle, les facteurs prédictifs à la reprise de l’emploi sont : l’âge avec un OR à 0,88 et IC [0,80-0,97], l’intensité de la douleur avec OR à 0,4 et IC [0,20-0,72] et le délai entre le diagnostic et la prise en charge multi disciplinaire avec un OR 0,42 et IC à [0,23-0,77]. Conclusion : le SDRC a impact socio-professionnel important. Des facteurs prédictifs au retour de l’emploi comme l’âge, le type de travail, la réduction de la douleur, la prescription des traitements appropriés et la prise en charge précoce sont constatés. Ils seront utilisés pour optimiser la prise en charge multidisciplinaire et coordonner les différents acteurs de santé, afin d’accompagner les patients vers la réintégration professionnelle.

    SémiologieMaladies infectieuses et tropicalesMédecine interne (cardiologie, endocrinologie, néphrologie…)Licence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    Identification des facteurs qui conduisent à la prescription d’inhibiteurs de la pompe à protons : étude qualitative auprès de médecins généralistes des Hauts-de-France

    Mathias Danset

    Introduction : les IPP sont au 3ème rang des prescriptions en France. La iatrogénie à leur usage au long cours est démontrée dans les études depuis 1999. 40 à 80 % des prescriptions d’IPP sont hors AMM selon l’HAS. Le coût annuel de leur prescription représentait 423 millions d’euros en 2018. L’objectif de notre enquête était d’identifier les facteurs qui conduisent les médecins généralistes à prescrire les IPP et de faire émerger des solutions d’aides à une prescription plus pertinente. Matériel et méthode : notre enquête était qualitative prospective, réalisée auprès de 10 médecins généralistes des Hauts-de-France par entretiens semi dirigés à réponses ouvertes. La saturation de données était obtenue au 8ème entretien. Résultats : tous les médecins avaient une méconnaissance des indications précises des IPP. La plupart des praticiens ne connaissait pas leurs effets secondaires. L’information délivrée pendant l’entretien les amenait à une réflexion sur leur pratique professionnelle. La grande majorité des praticiens évoquait le principe de précaution et la pression du patient ressentie pour se justifier d’une prescription inadaptée. La réévaluation et la déprescription n’étaient pas suffisamment envisagées. La densité de la consultation du patient pluripathologique, la facilité d’observance, le défaut de traçabilité des antécédents médicaux et le manque de collaboration attendue avec le gastro-entérologue étaient des freins cités par chacun des praticiens. La thématique des IPP n’était pas abordée dans leur formation. La rémunération sur objectifs de santé public depuis 2018 les sensibilisait sur la co-prescription d’AINS-IPP. Discussion : la méconnaissance des indications thérapeutiques et des effets secondaires aboutissait aux prescriptions inadaptées d’IPP. Les fausses croyances, le déséquilibre de la relation médecin-patient entrainaient un mésusage des IPP. En proposant la thématique des IPP, la formation continue pourrait développer les compétences. La commun

    Biostatistiques et épidémiologiePharmacologieSémiologieLicence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    Identification des freins et moteurs à l'élargissement du programme "Médecin Traitant Renforcé" aux maisons médicales des Hauts-de-France : "alternative au paiement à l'acte

    Thomas Pierre

    Introduction : le programme "Médecin Traitant Renforcé (MTR)" expérimente, dans le cadre de l'article 51 du projet de loi de financement de la sécurité sociale pour 2018, un mode de rémunération à la capitation pour les médecins généralistes libéraux français. Il semble présenter de nombreux avantages pour le médecin, le patient et le système de santé. Ce travail avait pour but d'identifier les freins et moteurs à l'adoption de ce programme chez les médecins généralistes libéraux des Hauts-de-France. Matériel et méthode : une étude qualitative à l'aide d'entretiens semi-dirigés a été menée auprès de 18 médecins généralistes des Hauts-de-France de mars à septembre 2023. Résultats : les éléments retrouvés conditionnant l'adoption ou non de ce modèle portaient principalement sur les modalités de rémunérations des praticiens, leurs conditions d'exercice ainsi que de l'impact du programme pour le patient. L'absence de confiance entre les médecins et l'État était également citée. Discussion : les médecins libéraux semblaient plutôt septiques mais le programme ne vise cependant pas à remplacer la rémunération à l'acte mais à proposer une alternative. Les jeunes médecins sont probablement une meilleure cible pour ce programme car il semble correspondre à leurs aspirations. Conclusion : ce travail a mis en lumière les éléments déterminants à l'adoption du programme MTR, qui relèvent pour la plupart de préférence quant à leurs modalités d'exercice plus que de vrais freins techniques.

    SémiologieMaladies infectieuses et tropicalesMédecine interne (cardiologie, endocrinologie, néphrologie…)Licence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    Identification des risques professionnels dans l'industrie textile en République Démocratique du Congo

    Panda Lukongo Kitronza

    IntroductionLe but de cette étude est de mettre en évidence les facteurs de risques professionnels liés aux conditions de travail.MéthodesCette étude qualitative basée sur les entretiens de groupe a été réalisée par une équipe pluridisciplinaire dans l'industrie textile de la région du Est de la RDC; comprenant un médecin de travail, un médecin de santé publique, un toxicologue, deux infirmiers du centre hospitalier de l'usine, un représentant du comité d'hygiène et un technicien de prévention. La démarche méthodologique a consisté en des entretiens en groupe, des observations et visites guidées de lieux de travail de l'entreprise.RésultatsDans la culture du coton, les effets d'une forte exposition aux pesticides peuvent entraîner des intoxications aiguës, chroniques et voire le décès. Les autres risques sont les accidents de travail, les maladies professionnelles, les troubles psychologiques. Dans l'industrie, les travailleurs sont exposés aux risques liés à l'empoussiérage des fibres de coton, aux facteurs des risques traumatiques, physiques (bruits, vibration) et chimiques (acides forts, bases fortes, solvants et colorants minéraux), ainsi qu'aux risques psychosociaux. La pollution de l'environnement et l’écotoxicité inhérente à ces activités restent l'effet de l'usage des grandes quantités d'intrants agricoles, engrais et produits phytosanitaires.ConclusionCette étude a permis de mettre en évidence les différents facteurs de risques auxquelles sont soumis les travailleurs textiles; ainsi que les risques environnementaux liés à cette activité. Cela est de nature à permettre la mise sur pied d'une stratégie efficace de prévention et de protection des travailleurs.

    Licence : The Pan African Medical Journal - ISSN 1937-8688. This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
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    Identification et analyse des problèmes liés à la pharmacothérapie, rencontrés en rétrocession chez les patients traités par antirétroviraux

    Amélie Léobon

    Introduction : l'évolution des antirétroviraux (ARV) et le vieillissement des patients VIH posent des défis, tels que les effets indésirables, interactions médicamenteuses et polymédications. Le pharmacien clinicien joue un rôle clé dans la gestion de ces problèmes liés à la pharmacothérapie (PLP) pour optimiser l'efficacité et la sécurité des traitements. Objectif : identifier et classer les éventuels PLP chez les patients recevant des antirétroviraux délivrés en rétrocession. Matériel et méthode : les patients sous ARV venant récupérer leur traitement en rétrocession entre janvier et mars 2024 ont été inclus dans cette étude prospective. Le pharmacien clinicien a identifié et pris en charge les PLP en ambulatoire. Les PLP ont été classés selon le système de classification du Pharmaceutical Care Network Europe (PCNE). Résultats : au total, 23 patients ont bénéficié d'un entretien pharmaceutique en rétrocession, avec 18 PLP identifiés (moyenne de 0,78 PLP/patient). Dix concernaient l'efficacité et 8 la sécurité du traitement. Trente interventions ont été réalisées, résolvant totalement ou partiellement 44,4 % des PLP. Dans 22,2 % des cas, le PLP n'a pas été résolu en raison d'un manque de coopération du patient, et dans 33,3 %, il a été jugé impossible à résoudre. Discussion – Conclusion : la prévalence des PLP était élevée chez les patients sous ARV, bien qu’ils soient relativement jeunes. Avec le vieillissement de cette population, le rôle du pharmacien devient essentiel pour optimiser leur prise en charge. Des consultations pharmaceutiques lors de l’initiation et du suivi du traitement antirétroviral seraient donc bénéfiques afin de renforcer le lien ville-hôpital.

    Biostatistiques et épidémiologieImmunologiePharmacologieLicence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    Identification et caractérisation d'ARN régulateurs chez Escherichia coli régulés par RpoS

    Demol Julien

    Les bactéries ont la capacité de s’adapter à leur environnement par une régulation fine de leur expression génique. Cette régulation génique s’opère par les facteurs sigma, sous-unités de l’ARN polymérase permettant la discrimination des promoteurs, et de l’aide éventuelle de cofacteurs pour permettre la transcription de sets de gènes spécifiques aux besoins de la bactérie. Les bactéries contrôlent également l’accumulation de leurs protéines, au niveau post-transcriptionnel, à l’aide notamment d’ARNnc permettant de moduler la traduction d’ARNm ciblés, par l’appariement : ARNm-ARNnc. Nous avons montré, grâce aux données obtenues en RNA-seq, ChIP-seq, Northern Blot et de fusions reportrices, que le facteur sigma RpoS induit ou module la transcription de ces ARNnc. Nous avons notamment observé que le facteur sigma RpoS est réprime (indirectement) la transcription de nombreux ARNnc et induisait celle d’au moins un ARNnc. . Afin d’étudier un exemple de conséquences de la régulation transcriptionnelle d’ARNnc par RpoS , nous avons choisi d’étudier la régulation de l’expression des curli, appendices extracellulaires impliqués dans l’adhérence et la formation de biofilm. Nous avons observé que l’expression des gènes csg est régulée à la fois transcriptionnellement et traductionellement par le facteur sigma RpoS et les ARNnc. Nous avons également pu observer une thermorégulation de l’expression des gènes structuraux des curli qui pourrait impliquer ces deux types de régulateurs

    BiochimieBiologie cellulaire et moléculaireLicence : https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
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    Identification et caractérisation des sources de contaminants dans des bassins versants d'usage mixte, approche intégrée - IDESOC

    Marina Coquery, Céline Duwig, Pauline Dusseux, B. Cournoyer, Matthieu Masson, Flora Branger, Lysiane Dherret, Mickaël Lagouy, Olivier Grandjouan, Amine Boukra, Loïc Richard, Malcie Baduel, Guillaume Nord, Lorenzo Spadini, Cédric Legout, Jean Martins, Nico Hachgenei, Armelle Crouzet, Laure Jullien, Sophie Darfeuil, Ons Chtiba, Lionel Elzear, Laurence Marjolet, Angélique Dominguez-Lage, Adrien Meynier-Pozzi, Baptiste Luton, Wessam Galia, Véronica Rodriguez-Nava, Emmanuelle Bergeron, Delphine Mouniée, Sihem Guesmi, Caroline Wybraniec, Nicolas Robinet, Inès Créti, Mila Betemps, Julie Josse

    Une méthodologie d’analyse spatiale, combinant géomatique et enquêtes sur les usages et pratiques, a été élaborée et mise en œuvre sur deux bassins versants (rural vs péri-urbain) de méso-échelle, afin d’identifier les sources potentielles de contaminants et leur localisation. En complément, la variabilité spatiale de la qualité de l’eau sur les cours d’eau de l’ensemble des deux bassins versants étudiés a été évaluée avec des techniques analytiques dites « low-cost » (analyse des caractéristiques de la matière organique dissoute - MOD - par spectrophotométrie UV-visible, paramètres microbiens par qPCR). Des sources potentielles ont été échantillonnées et analysées (ions majeurs, métaux, indicateurs UV-visibles pour la MOD et indicateurs microbien) afin de définir des empreintes biogéochimiques (ou signatures) sur les sites sélectionnés. Nous avons, tout d’abord, défini des empreintes biogéochimiques (ou signatures) spécifiques des différentes sources sur chaque bassin étudié. Un modèle de mélange biogéochimique a ensuite été appliqué sur des données issues de suivis d’évènements hydrologiques à l’exutoire de sous-bassins emboîtés, afin d’estimer les contributions des sources aux exutoires des deux bassins versants étudiés. Enfin, ce rapport présente les résultats de la contamination bactérienne observée sur les deux bassins versants.

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueBiostatistiques et épidémiologieLicence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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  • Lien vers la sourceThèse

    Identification et caractérisation fonctionnelle des cibles pharmacologiques des lactones macrocycliques des invertébrés

    Nicolas Lamassiaude

    Parmi la grande variété des espèces d’invertébrés parasites, le contrôle de la majorité d’entre elles passe par l’utilisation d’antiparasitaires tels que les lactones macrocycliques (MLs) et les isoxazolines. Cependant, l’émergence de parasites résistants à travers le monde rend la compréhension du mode d’action des antiparasitaires ainsi que l’identification de leurs cibles pharmacologiques nécessaires pour adapter les stratégies de lutte. Dans ce contexte, en utilisant une approche gène candidat, nous avons identifié les sous-unités codant les récepteurs au glutamate GluCls (avr-14, avr-15, glc-1, glc-2, glc-3, glc-4 et glc-5) des nématodes Caenorhabditis elegans, Brugia malayi et Parascaris univalens, ainsi que les récepteurs au glutamate (GluCl) et au GABA (rdl) du pou de corps humain Pediculus humanus humanus. L’expression hétérologue de ces sous-unités en œufs de xénope a permis d’identifier de nouveaux sous-types de GluCls et de caractériser le mode d’action des MLs chez les trois espèces de nématodes. Chez C. elegans, AVR-14B, GLC-2 et GLC-3 forment des récepteurs homomériques fonctionnels mais pas chez les nématodes parasites. Chez les trois espèces, AVR-14B et GLC-2 s’associent pour former des récepteurs sensibles aux MLs tandis que GLC-2 et GLC-3 ne s’associent que chez C. elegans et P. univalens. GLC-2/GLC-3 de P. univalens présente des propriétés pharmacologiques originales. Chez le pou humain, des tests de toxicité ont mis en évidence l’effet pédiculicide des MLs et des isoxalines et l’expression des sous-unités de canaux ioniques en œufs de xénope a permis de déterminer leur mode d’action préférentiel sur les GluCls et les récepteurs au GABA. La caractérisation de ces récepteurs est une première étape pour le développement de nouveaux antiparasitaires et pour le développement de nouvelles stratégies de lutte.

    Microbiologie (bactériologie, virologie)Parasitologie et mycologiePharmacologieLicence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
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    Identification of dengue type 2 virus in febrile travellers returning from Burkina Faso to France, related to an ongoing outbreak, October to November 2016

    Carole Eldin, Philippe Gautret, Antoine Nougairede, Mélanie Sentis, Laetitia Ninove, Nadia Saidani, Matthieu Million, Philippe Brouqui, Remi Charrel, Philippe Parola

    Dengue fever is rarely reported in travellers returning from Africa. We report two cases of dengue fever in travellers returning from Burkina Faso to France. One of them presented a severe dengue fever with ALT > 1,000 IU/L and pericarditis. Serotype 2 was identified. The cases reflect a large ongoing outbreak with over 1,000 reported cases between August and November in the capital city. Clinicians should consider dengue fever in malaria-negative febrile travellers returning from Africa.

    Parasitologie et mycologieMaladies infectieuses et tropicalesSanté publiqueLicence : This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) Licence. You may share and adapt the material, but must give appropriate credit to the source, provide a link to the licence, and indicate if changes were made.
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    Identification of genomic regions and candidate genes of functional importance for gastrointestinal parasite resistance traits in Djallonké sheep of Burkina Faso

    Isabel Álvarez, Iván Fernández, Albert Soudré, Amadou Traoré, Lucía Pérez-Pardal, Moumouni Sanou, Stephane A. R. Tapsoba, Nuria A. Menéndez-Arias, Félix Goyache

    AbstractA total of 184 Djallonké lambs from Burkina Faso with phenotypes for packed-cell volume (PCV), log-transformed fecal egg count (lnFEC), and FAffa MAlan CHArt (FAMACHA©) eye scores were typed with the OvineSNP50 BeadChip of Illumina to contribute to the knowledge of the genetic basis of gastrointestinal (GIN) parasite resistance in sheep. Association analysis identified a total of 22 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) related with PCV (6 SNPs), lnFEC (7), and FAMACHA scores (9) distributed among 14 Ovis aries chromosomes (OAR). The identified SNPs accounted for 18.76 % of the phenotypic variance for PCV, 21.24 % for lnFEC, and 34.38 % for FAMACHA scores. Analyses pointed out the importance of OAR2 for PCV, OAR3 for FAMACHA scores, and OAR6 for lnFEC. The 125 kb regions surrounding the identified SNPs overlapped with seven previously reported quantitative trait loci (QTLs) for the traits analyzed in the current work. The only chromosome harboring markers associated with the three traits studied was OAR2. In agreement with the literature, two different chromosomal areas on OAR2 can play a major role in the traits studied. Gene-annotation enrichment analysis allowed us to identify a total of 34 potential candidate genes for PCV (6 genes), lnFEC (4), and FAMACHA scores (24). Annotation analysis allowed us to identify one functional term cluster with a significant enrichment score (1.302). The cluster included five genes (TRIB3, CDK4, CSNK2A1, MARK1, and SPATA5) involved in immunity-related and cell-proliferation processes. Furthermore, this research suggests that the MBL2 gene can underlie a previously reported QTL for immunoglobulin A levels on OAR22 and confirms the importance of genes involved in growth and size (such as the ADAMTS17 gene on OAR18) for GIN resistance traits. Since association studies for the ascertainment of the genetic basis of GIN resistance may be affected by genotype–environment interactions, obtaining information from local sheep popu

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueMicrobiologie (bactériologie, virologie)Licence : https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ This work is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License. To view a copy of this licence, visit
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    Identification of High-Yielding Iron-Biofortified Open-Pollinated Varieties of Pearl Millet in West Africa

    Prakash I. Gangashetty, Mohammed Riyazaddin, Moussa Daouda Sanogo, Drabo Inousa, Kassari Ango Issoufou, Peter A. Asungre, Ousmane Sy, Mahalingam Govindaraj, Angarawai Ijantiku Ignatius

    Pearl millet is a predominant food and fodder crop in West Africa. This study was carried out to test the newly developed open-pollinated varieties (OPVs) for field performance and stability for grain yield, grain iron (Fe), and grain zinc (Zn) contents across 10 locations in West Africa (i.e., Niger, Nigeria, Mali, Burkina Faso, Senegal, and Ghana). The test material consisted of 30 OPVs, of which 8 are Fe/Zn biofortified. The experiment was conducted in a randomized complete block design in three replications. ANOVA revealed highly significant variability for grain yield and micronutrient traits. The presence of genotype × environment (G × E) indicated that the expressions of traits are significantly influenced by both genetic and G × E factors, for grain Fe and Zn contents. Days to 50% flowering and plant height showed less G × E, suggesting these traits are largely under genetic control. The genotypes CHAKTI (46 days), ICTP 8203 (46 days), ICMV 177002 (50 days), ICMV 177003 (48 days), and Moro (53 days) had exhibited early flowering across locations leading to early physiological maturity. CHAKTI (1.42 t/ha yield; 62.24 mg/kg of grain Fe, 47.29 mg/kg of grain Zn) and ICMP 177002 (1.19 t/ha yield, 62.62 mg/kg of grain Fe, 46.62 mg/kg of grain Zn) have performed well for grain yield and also for micronutrients, across locations, compared with the check. Additive Main Effect and Multiplicative Interaction (AMMI) ANOVA revealed the highly significant genotypic differences, the mean sum of squares of environment, and its interaction with the genotypes. Based on the AMMI stability value (ASV), the most stable genotype is SOSAT-C88 (ASV = 0.04) for grain yield and resistance to downy mildew; mean grain yield and stability rankings (YSI) revealed that the genotypes CHAKTI, SOSAT-C88, and ICMV IS 99001 were high yielding and expressed stability across regions. The strong correlation (r = 0.98∗∗) of grain Fe and Zn contents that merits Fe-based selection is highly rewardi

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueMicrobiologie (bactériologie, virologie)Licence : This is an open-access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License (CC BY). The use, distribution or reproduction in other forums is permitted, provided the original author(s) and the copyright owner(s) are credited and that the original publication in this journa
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    Identification of spore-forming bacteria isolated from contaminated Lowenstein Jensen media and effectiveness of Vancomycin to reduce Mycobacterial culture contamination in Burkina-Faso

    Antoinette Kaboré, Juliette Tranchot-Diallo, Hervé Hien, Ousséni Zouré, Dezémon Zingué, Adama Sanou, Michel Kireopori Gomgnimbou, Géraldine Daneau, Georges Anicet Ouédraogo, Nicolas Méda, Lassana Sangaré

    The type of commensal microorganisms can influence the efficiency of sputum decontamination for TB diagnosis. A basic characterization of contaminants from LJ contaminated media showed that Gram positive Spore Forming Bacteria (SFB) were the major contaminants. This study aims to identify the species of this contaminants and to evaluate the effectiveness of VCNT at 10 µg of vancomycin to reduce mycobacterial culture contamination mainly linked to SFB. Fifty-three SFB isolated between February 2016 and May 2017 were used. The effectiveness of LJ with VCNT at 10 µg of Vancomycin were evaluated with sputum collected in the same period. SFB had been stored at −20 °C and identified after subculture onto 5% sheep blood Columbia agar and incubated at 37 °C during 24 h. Bacteria cells and isolated colonies were described. API 50CH/B was performed and MALDI-TOF MS was used for external quality control. Thirty- five (66%) isolates representing 4 genera (Bacillus, Paenibacillus, Brevisbacillus and Lysinibacillus) including 10 species were identified. The most important species were Bacillus cereus (30%) and Bacillus licheniformis (21%). Eighteen (34%) isolates were non-reactive Bacillus. The overall contamination rate on LJ with VCNT at 10 µg of vancomycin was statistically lower than which without VCNT (18.7% versus 43.8%) (p = 0.01). The most important SFB identified were B. cereus and B. licheniformis. Almost all identified strains were similar to those currently isolated in fermented traditional food suggesting in part food related contaminants. VCNT containing 10 µg of vancomycin is a good alternative method to reduce mycobacterial culture contamination.

    Santé publiqueLicence : Open Access http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ This article is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License, which permits use, sharing, adaptation, distribution and reproduction in any medium or format, as long as you give appropriate credit to the original autho
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    Identification of Streptococcus suis Meningitis by Direct Triplex Real-Time PCR, Burkina Faso

    Mahamoudou Ouattara, Mamadou Tamboura, Dinanibe Kambire, Mahamoudou Sanou, Kalifa Ouattara, Malika Congo, Adama Kaboré, Soufiane Sanou, Elie Kabré, Sable Sharpley, Theresa Tran, Stephanie Schwartz, Soumeya Ouangraoua, Abdoul-salam Ouedraogo, Lassana Sangaré, Rasmata Ouedraogo-Traore, Cynthia G. Whitney, Bernard Beall

    Meningitis confirmation in Burkina Faso uses PCR for detecting Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, or Hemophilus influenzae. We identified 38 cases of meningitis among 590 that were PCR-positive for 3 nonpneumococcal streptococcal pathogens, including 21 cases of Streptococcus suis. Among the country’s 13 regions, 10 had S. suis–positive cases.

    Biologie cellulaire et moléculaireGénétiqueMicrobiologie (bactériologie, virologie)Licence : This is a publication of the U.S. Government. This publication is in the public domain and is therefore without copyright. All text from this work may be reprinted freely. Use of these materials should be properly cited.
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    Identification of Streptococcus suis Meningitis through Population-Based Surveillance, Togo, 2010–2014

    Haoua Tall, Berthe-Marie Njanpop-Lafourcade, Didier Mounkoro, Loukoumane Tidjani, Kodjo Agbenoko, Issifou Alassani, Moussa Amidou, Stanislas Tamekloe, Kenneth G. Laing, Adam A. Witney, Jason Hinds, Mark P.G. van der Linden, Bradford D. Gessner, Jennifer C. Moïsi

    During 2010–2014, we enrolled 511 patients with suspected bacterial meningitis into surveillance in 2 districts of northern Togo. We identified 15 persons with Streptococcus suis infection; 10 had occupational contact with pigs, and 12 suffered neurologic sequelae. S. suis testing should be considered in rural areas of the African meningitis belt.

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